Estudios de genómica estructural y funcional en peces con interés en acuicultura

Resumen

El Orden Pleuronectiformes está formado por un elevado número de especies de peces planos que tienen un gran interés, por un lado, desde el punto de vista evolutivo, ya que presentan genomas muy pequeños y variables, y por otro, desde el punto de vista económico, pues algunas especies como el lenguado, la platija, el fletán o el rodaballo son cultivadas a gran escala. De hecho, existen varios proyectos para analizar sus genomas y utilizar los datos obtenidos para la mejora de su cultivo. En este sentido, sería muy interesante tener identificados los ADNs repetidos existentes en sus genomas. Hasta hoy, sólo se ha caracterizado un ADN satélite en una especie de pez plano endémica de Brasil (Achirus lineatus) y otro en una especie endémica del sur de España, la acedía (Dicologoglossa cuneata). En esta Tesis se han caracterizado dos ADNs satélite centroméricos, uno (familia SacI) en el fletán (Hippoglossus hippoglossus) y otro (familia PvuII) en tres especies del Género Solea. Discutimos su localización, características moleculares y modo de evolución. Además, hemos estudiado una secuencia repetida, que hemos denominado ACA72, caracterizada en un extenso grupo de peces planos, y que hemos utilizado como marcador para clarificar las relaciones filogenéticas dentro del Orden Pleuronectiformes. Hemos puesto de manifiesto la presencia de dicha secuencia en otros grupos de peces del Orden Perciformes y, analizando las bases de datos, hemos constatado su existencia en otros Ordenes de peces, tales como Gasterosteiformes, Tetraodontiformes y Cypriniformes, lo que nos ha permitido establecer relaciones filogenéticas entre todos estos grupos de peces. Con respecto a los esturiones, algunas de las especies de este Orden (Acipenseriformes), se han venido explotando para la producción de caviar y de carne, por lo que aparte del interés evolutivo al ser especies ancestrales, son también de gran interés desde el punto de vista económico. Adicionalmente, hay que resaltar que muchas poblaciones de esturiones se encuentran en franco retroceso, estando muchas especies en peligro de extinción. Todo ello hace que su cultivo sea prioritario y se impone tener un conocimiento científico adecuado de tales organismos que ayuden a ello. Uno de los principales objetivos es el conocimiento de la determinación y diferenciación sexual ya que los esturiones son unos peces que tardan en madurar sexualmente de 5 a 20 años según la especie, sin que hasta el final, se pueda diferenciar morfológicamente entre sexos. La identificación precoz del sexo en los esturiones para poder identificar a las hembras (productoras del caviar) en los primeros estadios es, por lo tanto, de un gran interés. En esta Memoria se ha realizado una hibridación sustractiva con tejido gonadal de machos y hembras de la especie Acipenser naccarii, obteniéndose una genoteca de hembras y una genoteca de machos. Posteriormente, hemos profundizado en el análisis de los genes encontrados que hemos considerado podían intervenir en el desarrollo gonadal. Para ello, se ha realizado un estudio de expresión diferencial entre sexos, por medio de PCR cuantitativa, con algunos de los genes seleccionados, tales como ZP3.2, ZP3.3, proteína de unión al calcio y ferritina, ayudando a dilucidar en cierto modo, la importancia de dichos genes en la diferenciación sexual de estos peces.