Perfiles de metilacion de genes supresores tumorales en el cancer de vejiga

  1. GARCIA-BAQUERO GARCIA DE PAREDES, RODRIGO
Dirigée par:
  1. J. L. Álvarez-Ossorio Fernández Directeur
  2. Marta Sanchez Carbayo Martin Directeur/trice

Université de défendre: Universidad de Cádiz

Fecha de defensa: 30 juillet 2012

Jury:
  1. Antonio Lorenzo Peñuelas President
  2. Juan Bosco López Sáez Secrétaire
  3. Pilar González Peramato Rapporteur
  4. Ernesto Sánchez Sánchez Rapporteur
  5. A. Serrano Rapporteur
Département:
  1. Cirugía

Type: Thèses

Teseo: 328967 DIALNET

Résumé

La alteración en el estado de metilación de genes supresores tumorales es un fenómeno que se presenta desde el inicio de la carcinogénesis, pudiendo interpretarse como un potencial indicador de cáncer. El objetivo de este estudio es evaluar el estado de metilación de un panel de genes supresores tumorales e interpretarlos como marcadores de estratificación, pronóstico y diagnóstico en el cáncer de vejiga. Diseño experimental. Se evaluó el estado de metilación de un panel de 18 genes supresores tumorales mediante el análisis multiparamétrico de metilación MS-MLPA. Como material biológico se emplearon líneas celulares de cáncer de vejiga (n=14), tejido tumoral parafinado (n=61), y dos grupos independientes de muestras de orina (n=120 y n=128), que incluyeron pacientes con cáncer de vejiga (n=70 y n=100, respectivamente) y pacientes controles (n=50 y n=28, respectivamente). Resultados. Los genes metilados con mayor frecuencia en las líneas celulares fueron RUNX3, ID4, TWIST1 y CCND2, confirmándose su alta frecuencia de metilación en los tres tipos de muestras analizadas. Los genes PRDM2, HLTF, ID4, DLC1, BNIP3, H2AFX, CACNA1G, TGIF y CACNA1A fueron identificados como nuevos candidatos metilados en el cáncer de vejiga. Los genes metilados con mayor frecuencia en los tumores de vejiga fueron CCND2 (52.5%), ID4 (39.3%), y RUNX3 (32.8%), resultando la metilación de los genes RUNX3 (p 0.026), TWIST1 (p 0.009), SFRP4 (p 0.002) y CCND2 (p 0.027) asociada significativamente con el estadio tumoral. CCND2, SCGB3A1 y RUNX3 fueron también los genes más frecuentemente metilados en los dos grupos independientes de muestras de orina. Los análisis de las curvas ROC revelaron un alto rendimiento diagnóstico para el gen RUNX3 en ambos grupos de muestras de orina. Es importante destacar que, en el grupo de muestras de orina de entrenamiento, la metilación del gen CACNA1A se asoció con un mayor riesgo de recurrencia. En el grupo de muestras de orina de validación, la metilación del gen PRDM2 se asoció a un mayor riesgo de recurrencia y la metilación del gen BNIP3 a una menor supervivencia cáncer-específica. Conclusiones. El estado de metilación de los genes que se evaluaron es útil como biomarcador tumoral relevante, y apoya el papel de la epigenética en la patogénesis del cáncer de vejiga. El ensayo MS-MLPA muestra aplicación clínica para la estratificación tumoral y el pronóstico empleando muestras de tejido tumoral y muestras de orina, y para el diagnóstico no invasivo empleando muestras de orina.