Acoplamiento bento-pelágico en las zonas costeras.
Biogeoquímica de ecosistemas acuáticos contaminados por drenaje ácido de minas.
Consecuencias biogeoquímicas de la acumulaciones masivas de macroalgas en zonas intermareales.
Desarrollo de métodos de medida de oxígeno en concentraciones trazas en zonas de mínimos de oxígeno.
Dinámica de poblaciones microbianas en zonas costeras y su impacto a la salud humana.
Ecología del microfitobentos en las zonas intermareales.
Ecología microbiana y ciclos biogeoquímicos en sistemas acuáticos.
Impacto del cambio climático, incluyendo los eventos climáticos extremos, en el metabolismo microbiano en zonas costeras y la producción y liberación de gases de efecto invernadero.
Metabolismo microbiano en zonas de mínimos de oxígeno.
Microbiología de los biofilms en las plantas de tratamiento de aguas residuales y en otros sistemas de depuración.